Systematisch onderzoek naar terugkerende deleties van niet-coderende regio's bij borsttumortransformatie
Onderzoekssamenvatting
Het verwijderen van grote DNA-fragmenten is een van de meest voorkomende gebeurtenissen bij kanker, en de meeste van deze terugkerende deleties bevinden zich in het niet-coderende deel van het menselijk genoom. Het is onduidelijk of deze niet-coderende terugkerende deleties essentieel zijn bij het aansturen van de transformatie en wat zijn de moleculaire mechanismen achter dergelijke gebeurtenissen.
Voorgestelde oplossing
We hebben een systematisch dual-CRISPR-screeningsysteem ontwikkeld dat in staat is om duizenden grote DNA-fragmenten in het menselijk genoom individueel te verwijderen en de gerelateerde fenotypeveranderingen te testen. In dit voorstel willen we een dual-CRISPR-bibliotheek die zich richt op alle potentiële terugkerende niet-coderende deleties bij borstkanker en testen of een van deze deleties transformatie en tumorgenese zal stimuleren. We zijn van plan de screening uit te voeren in zowel celcultuur- als muismodellen.
Verwachte uitkomst
We verwachten verschillende tophits te identificeren regio's die als focus zouden kunnen dienen voor toekomstige studies.
Vervolgstappen
De resultaten van dit unieke risicovolle project zullen de basis leggen voor het bestuderen van de moleculaire mechanismen van hoe de terugkerende deleties van niet-coderende regio's tumorgenese aansturen. Deze belangrijke niet-coderende regio's zouden kunnen dienen als geen vel biomarkers en doelwitten voor tumorpreventie.